1.环境处理：
在池塘放水前1周，用50-100倍的EM菌液稀释液代替石灰及漂白粉等均匀喷洒净化环境。放养前3～6天，用100倍的EM菌液稀释液泼洒水面（EM菌液用量视水质情况，为总水量的万分之一、10万分之一或30万分之一），水质较差的地方应适当缩短泼洒时间。水质以绿色晶亮为好。
2.调节水质的方法（鳗池）：
1天2次高密度换水的水池，就不宜直接均匀泼入，而应泼在增氧机边或进水口，使EM菌液微生物不断流动扩散，以利在最短时间内分解有害物质、下脚料和达到尽快稳定水质。土塘海水养鳗则宜在每次换水后泼洒EM菌液稀释液，比例按水量的10～30万分之一为宜。
3.鱼饲料的加工：
把EM菌液加清水兑成300～500倍稀释液（甲鱼可用100倍）以后，与粉状的饲料一起搅拌均匀，成团状饲喂。水分含量约在40～55%（水分多少随饲料的干湿程度而定）。投喂新鲜动物性饲料的甲鱼池，可先把饲喂料饺碎后，与人工配合饲料、EM菌液100倍稀释液一起搅拌均匀饲喂。
4.食台处理：
每次投饲前要检查食台，用200～500倍的EM菌液稀释液净化食台、清扫食台残饲。
5.饲料加工处的处理：
用200～500倍的EM菌液稀释液均匀喷洒和清洗搅拌机等工具、地面及四周墙壁，以保证饵料卫生。
6 ．鲍鱼养殖（福建某公司经验）
（ 1 ）按池水量 20 万分之一配制 EM菌液发酵液泼洒水面，视水质确定间隔时间。
（ 2 ）用 100 倍 EM菌液浸泡海带（先切碎）数小时后投喂。用 EM菌液后，鲍鱼健壮不生病，换水时间延长 1 倍。
7 ．紫菜养殖
（ 1 ）养殖网的酸处理：用 500倍 EM菌稀释液溶入酸液中按常规方法对养殖网进行酸处理，每 10 天处理一次。
（ 2 ）养殖网除臭：紫菜收获后，养殖网放置期间，可用EM菌液除臭。方法是在养殖网上喷洒100-200倍EM菌稀释液，然后盖上塑料膜，一段时间后即可去除腥臭味。
（ 3 ）紫菜成品加工时可往槽罐中滴注 1000 倍EM菌稀释液，可消除腥味，更容易洗涤。

资料来源：徐州森田生物科技有限公司http://www.sistan.com.cn